Normalmente, as capivaras vivem em grupos grandes com um macho dominante e várias fêmeas. Há ainda os chamados machos satélites, que buscam áreas para formar seus próprios grupos. Esses animais são territorialistas, o que ocasionalmente resulta em disputas entre eles, mas geralmente são pacíficos em relação aos seres humanos e preferem se afastar quando se sentem ameaçados pela presença de pessoas. As capivaras também são alvo de predadores, como jacarés, onças, sucuris e aves de rapina, e fazem parte da complexa teia de relações que mantém o equilíbrio na natureza.