Belo Horizonte ; Tente se imaginar lendo um calhamaço de milhares de páginas com bilhões de palavras formadas apenas por quatro letras (A, T, C e G). Não há pontos, vírgulas ou parágrafos e a mensagem essencial do texto está no meio disso tudo. É assim que os cientistas se veriam diante do material genético se não fosse a tecnologia. Na última década, o sequenciamento de genomas completos foi aprimorado e se tornou cerca de 10 mil vezes mais barato. Mesmo assim, algumas dificuldades permanecem. Hoje, a grande questão é melhorar a análise dos bilhões de bits gerados por computadores ; faltam softwares e mão de obra especializada para tanto trabalho.
Diante dessa realidade, novas linhas de pesquisa em bioinformática buscam uma forma mais eficaz e simples de análise. Um desses estudos é coordenado pelo matemático João Meidanis, sócio-fundador da empresa Scylla Bioinformática e professor da Universidade Estadual de Campinas (Unicamp). Ao lado de um ex-aluno de doutorado, Meidanis investe na técnica single-cut-or-join (expressão representada pela sigla em inglês SCJ e que significa corte único ou junção), que compara genomas inteiros de organismos.