Apesar de não fazer parte da cronologia oficial da série, Operation Raccoon City se propõe a mostrar o ;lado B; da história contada em Resident evil 2. Em vez de jogar com os heróis Leon e Claire, você é parte do Wolfpack, um grupo de operações especiais que trabalha para os vilões da série, a corporação Umbrella, e atua em pontos-chave da trama clássica: primeiro, ao tentar recuperar o vírus G do cientista Willian Birkin. A missão dá errado, e logo o grupo é enviado para a cidade para fazer uma queima de arquivo, destruindo qualquer prova de que a empresa se envolveu no desastre biológico.