O CNPQ é o principal órgão de fomento a pesquisa do país e Filgueiras tentava se articular para impedir o esvaziamento do órgão. O gestor não foi avisado com antecedência de sua demissão, e abandona projetos em andamento. O órgão chegou a financiar, no ano passado, 84 mil bolsas de pesquisa em todo o país.
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Pontes vem tendo atuação apagada no governo, justamente em um período em que o país e o mundo mais voltam suas atenções para pesquisas científicas. Existe uma corrida para encontrar uma vacina ou remédio eficaz contra o coronavírus. No ano passado, o CNPQ teve forte redução em seu orçamento destinado para a compra de equipamentos.