De acordo com as informações iniciais divulgadas pela Força Aérea Brasileira, o piloto do avião entrou em contato com a estação rádio do aeroporto de Guarujá, antiga base aérea de Santos, para avisar que ia fazer o procedimento de pouso. Segundo a FAB, logo em seguida, o piloto informou que não tinha conseguido visualizar o local para pouso e arremeteu. Depois disso, teria se chocado contra um prédio no bairro do Boqueirão, em Santos, litoral de São Paulo.