"Omar al Bashir e outros foram acusados de incitar e participar do assassinato de manifestantes", segundo uma declaração do promotor.
As acusações contra Bashir resultaram da investigação sobre a morte de um médico durante os protestos na capital.
"O procurador-geral recomendou acelerar a investigação sobre a morte dos manifestantes", acrescentou o comunicado.
Em 11 de abril, após meses de protestos, o exército forçou Al Bashir a deixar o poder depois de quase três décadas conduziando a política com mão de ferro.