Pressentindo o perigo após ter visitado um campo de refugiados, ele organizou rapidamente, entre março e agosto de 1939, a pedido das famílias, a partida de oito trens com 699 crianças, rumo à Grã-Bretanha.
Um nono trem, com 250 menores, partiria em 3 de setembro daquele ano, mas, nesse dia, a Grã-Bretanha declarou guerra à Alemanha. O trem foi bloqueado, e nunca mais se ouviu falar dessas crianças.
Os "meninos de Winton" e seus descendentes vivem agora na Grã-Bretanha, Israel, Canadá e muitos outros países.
Sir Nicholas Winton manteve silêncio sobre seu gesto por quase meio século.