O pedido de federalização teria sido da presidente Dilma Rousseff. Durante os debates que antecederam a votação do projeto, alguns deputados se posicionaram contra, por acreditarem que o prédio deveria ficar nas mãos do GDF, o responsável pela sua construção. Artistas da cidade também encaram com desconfiança a iniciativa do governo federal e acreditam que podem perder espaço de representação no museu.